16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3851 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  90.32 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  87.1 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  87.1 
 
 		 382 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  87.1 
 
 		 424 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  87.1 
 
 		 422 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  80.65 
 
 		 425 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  74.19 
 
 		 421 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  54.05 
 
 		 421 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  60.71 
 
 		 436 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>