33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2890 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  91.2 
 
 		 127 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  90.4 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  88.8 
 
 		 127 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  68.8 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  65 
 
 		 120 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  49.59 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  48.8 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  42.98 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  35.25 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  28.33 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30.83 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  26.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  24.58 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  31.19 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  25.62 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  25.62 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  24.55 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  30.91 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  22.73 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  25.47 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  20.79 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2658  hypothetical protein  24.11 
 
 		 227 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>