39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0364 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  89.31 
 
 		 354 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  89.02 
 
 		 354 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  96.24 
 
 		 354 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  90.17 
 
 		 365 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  96.53 
 
 		 354 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  96.53 
 
 		 354 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  89.31 
 
 		 354 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  89.31 
 
 		 354 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  73.26 
 
 		 358 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  70.93 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  72.83 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  71.3 
 
 		 354 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  69.48 
 
 		 354 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  59.54 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  42.98 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  35.03 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  35.41 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.97 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  35.84 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  35.26 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  32.2 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  29.97 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  31.1 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  27.27 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  26.3 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  28 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  30.26 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  29.17 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>