18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0114 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  80.75 
 
 		 206 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  80.75 
 
 		 206 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  77.32 
 
 		 213 aa  284  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  76.92 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  76.44 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  75.96 
 
 		 208 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  76.44 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  73.68 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  57.07 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  52.33 
 
 		 222 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  48.4 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  51.65 
 
 		 174 aa  187  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  47.37 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  46.39 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  32.99 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  24.39 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>