18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1176 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0817  putative bacteriophage protein  88.66 
 
 
399 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1176  putative bacteriophage protein  100 
 
 
399 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118784  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3651  putative bacteriophage protein  50.26 
 
 
389 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0414851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2410  putative bacteriophage protein  49.09 
 
 
393 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1803  putative bacteriophage protein  47.94 
 
 
393 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2245  putative bacteriophage protein  49.51 
 
 
396 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.466176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2200  hypothetical protein  29.78 
 
 
399 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243728  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1285  hypothetical protein  31.35 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1015  hypothetical protein  31.35 
 
 
381 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.573023  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1252  hypothetical protein  31.35 
 
 
381 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1242  hypothetical protein  26.67 
 
 
399 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2933  hypothetical protein  26.92 
 
 
399 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  30.1 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  24.42 
 
 
394 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  25.09 
 
 
689 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1121  hypothetical protein  24.1 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  37.14 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1049  hypothetical protein  26.7 
 
 
472 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.819302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>