232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0885 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  99.38 
 
 
324 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  98.77 
 
 
324 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  97.84 
 
 
324 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
324 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  99.07 
 
 
324 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  85.09 
 
 
320 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  84.78 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  84.78 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  84.16 
 
 
320 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  84.78 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  84.78 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  84.78 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  83.54 
 
 
320 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  83.85 
 
 
320 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  78.88 
 
 
321 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  63.44 
 
 
322 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  63.12 
 
 
322 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  64.06 
 
 
322 aa  394  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  62.93 
 
 
319 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  61.88 
 
 
322 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  60.19 
 
 
319 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  60.19 
 
 
319 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  60.19 
 
 
319 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 
329 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
304 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
329 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 
336 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
336 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
339 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
302 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
336 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 
369 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
304 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
323 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
322 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
326 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 
323 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
354 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
324 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
324 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 
332 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
301 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
309 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
316 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
301 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
354 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  28.67 
 
 
333 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  30.38 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  30.38 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  29.26 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  28.9 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  28.51 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  29.96 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  30.13 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  29.96 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  28.27 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.53 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  29.83 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  25.79 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  25.4 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  23.46 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  27.14 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2289  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1872  anthranilate phosphoribosyltransferase  23 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2855  anthranilate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1671  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.82 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  27.18 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  26.23 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0064  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4155  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1160  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  26.09 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.86 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1771  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.19 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.983535  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1468  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  31.39 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  23.1 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  29.46 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1689  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.53 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.304746  normal  0.0692576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>