32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2111 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  100 
 
 		 108 aa  224  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  62.96 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  62.96 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  30.61 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  35.16 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  29 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  28.71 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  29.29 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  29.29 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  28.28 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  28.28 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  28.28 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  31.18 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  28.28 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  28.28 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  31.4 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.49 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  34.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  30.14 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  34.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  28.12 
 
 		 110 aa  43.5  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 		 120 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  27.08 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  28.4 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  27.5 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  27.27 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  26.37 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  27.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  26.25 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>