33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1371 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 407 aa  813    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  61.43 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  61.43 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  28.75 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  25.76 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  26.28 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  25.96 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  25.96 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  25.96 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  25.96 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  26.02 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  25.32 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  25.32 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  24.94 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  26.04 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  26.39 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  26.91 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  23.6 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  24.29 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  24.29 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  24.35 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  24.35 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  24.35 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  24.35 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  23.82 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  23.65 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  22.19 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  22.94 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  22.54 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  22.17 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  23.47 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  22.83 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>