16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1596 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1596  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0306  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  41.53 
 
 
253 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1399  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  34 
 
 
248 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  23.17 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.19 
 
 
299 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.06 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  22.34 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  23.68 
 
 
292 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.87 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.74 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  29.91 
 
 
418 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  30.77 
 
 
407 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  22.91 
 
 
314 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  21.82 
 
 
313 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 
299 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.83 
 
 
292 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>