More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3659 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3659  carbonic anhydrase  100 
 
 
347 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0725502  normal  0.181373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0545  carbonic anhydrase  50.31 
 
 
340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  hitchhiker  0.00175013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  43.45 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  44.21 
 
 
340 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0741  carbonic anhydrase  45.9 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1506  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.15 
 
 
340 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2259  carbonic anhydrase  43.16 
 
 
339 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.288291  normal  0.676633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1749  carbonic anhydrase  45.43 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5022  carbonic anhydrase  43.03 
 
 
348 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.585067  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  37.42 
 
 
176 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  32.08 
 
 
174 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  36.13 
 
 
177 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.1 
 
 
166 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35304  predicted protein  35.95 
 
 
175 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  34.57 
 
 
189 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.56 
 
 
169 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  32.32 
 
 
179 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.02 
 
 
180 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  34.76 
 
 
185 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  32.35 
 
 
172 aa  98.2  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  38.06 
 
 
176 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  32.28 
 
 
179 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  37.09 
 
 
180 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  31.68 
 
 
169 aa  97.4  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  36.73 
 
 
178 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  31.76 
 
 
183 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  33.11 
 
 
170 aa  96.7  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.87 
 
 
185 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  31.76 
 
 
182 aa  95.9  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  31.58 
 
 
184 aa  95.9  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  30.3 
 
 
184 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  36.77 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  34.87 
 
 
181 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  33.77 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  31.71 
 
 
181 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  30.3 
 
 
184 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  34.9 
 
 
173 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  26.88 
 
 
175 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  33.77 
 
 
180 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  32.32 
 
 
180 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  27.5 
 
 
172 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  32.93 
 
 
179 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  38.46 
 
 
185 aa  94.4  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  31.25 
 
 
167 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  32.32 
 
 
192 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  32.89 
 
 
182 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  30.3 
 
 
256 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  29.7 
 
 
184 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  30.3 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  31.06 
 
 
256 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  33.55 
 
 
181 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  32.91 
 
 
182 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  31.87 
 
 
167 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  29.27 
 
 
179 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
184 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  38.26 
 
 
177 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  32.05 
 
 
182 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  29.56 
 
 
170 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  30.81 
 
 
178 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  34.15 
 
 
179 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  34.44 
 
 
172 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  32 
 
 
177 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  27.95 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  32.48 
 
 
185 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  27.33 
 
 
169 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  32.89 
 
 
182 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  31.71 
 
 
182 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_002950  PG1211  hexapeptide transferase family protein  32.21 
 
 
192 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.534657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
182 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  34.23 
 
 
172 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  43.33 
 
 
188 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  33.13 
 
 
189 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  31.17 
 
 
180 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  31.71 
 
 
182 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  34 
 
 
174 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  27.27 
 
 
184 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  32 
 
 
180 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  30.23 
 
 
178 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  28.9 
 
 
182 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  32.12 
 
 
175 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  34.38 
 
 
224 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  32.12 
 
 
175 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  31.1 
 
 
185 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  32.37 
 
 
177 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 
174 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  32.3 
 
 
184 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  31.71 
 
 
181 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  28.31 
 
 
168 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  34.84 
 
 
187 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  31.52 
 
 
175 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  30.32 
 
 
180 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.1 
 
 
174 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  31.71 
 
 
187 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  30.32 
 
 
180 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  30.32 
 
 
180 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  31.71 
 
 
187 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>