25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1485 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  100 
 
 		 513 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  78.14 
 
 		 515 aa  814    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  65.35 
 
 		 523 aa  683    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  94.74 
 
 		 513 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 513 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  81.1 
 
 		 514 aa  863    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  79.18 
 
 		 519 aa  816    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  53.95 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  43.1 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  44.26 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  40 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  40.78 
 
 		 519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  37.58 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  40.51 
 
 		 519 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  37.58 
 
 		 468 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  35.29 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  29.34 
 
 		 471 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  29.85 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  29.98 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  29.22 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  26.39 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  26.85 
 
 		 515 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  23.06 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  38.96 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  23.43 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>