12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0454 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  98.1 
 
 		 352 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  30.81 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  32.53 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  28.22 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  31.87 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  30.89 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  29.25 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  27.44 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  29.3 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  28.07 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  29.67 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>