17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4365 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  340  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  54.32 
 
 
161 aa  190  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  51.85 
 
 
161 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  49.08 
 
 
160 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  47.62 
 
 
172 aa  157  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  48.08 
 
 
161 aa  157  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  45.06 
 
 
162 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  44.03 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  49.29 
 
 
135 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  34.71 
 
 
162 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  34.71 
 
 
162 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  40.17 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  34.31 
 
 
196 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  37.27 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  37.93 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  29.51 
 
 
199 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>