18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4319 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4319  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  61.45 
 
 		 296 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  49.15 
 
 		 296 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  49.15 
 
 		 296 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  49.15 
 
 		 296 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  48.78 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  46.75 
 
 		 297 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  46.75 
 
 		 297 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  34.15 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>