25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1716 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  94.74 
 
 		 513 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  78.54 
 
 		 515 aa  816    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  63.69 
 
 		 523 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 513 aa  1059    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  94.74 
 
 		 513 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  79.27 
 
 		 514 aa  849    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  77.76 
 
 		 519 aa  808    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  53.95 
 
 		 514 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  42.26 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  43.62 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  41.29 
 
 		 519 aa  338  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  41.02 
 
 		 519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  39.79 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  37.58 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  36.93 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  37.58 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  29.74 
 
 		 476 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  29.34 
 
 		 471 aa  226  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  29.83 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  29.11 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  26.77 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  26.22 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  22.84 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  38.96 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  22.95 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>