15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0298 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  88.65 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0550  hypothetical protein  89.01 
 
 		 302 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2353  tetratricopeptide region  61.76 
 
 		 283 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.211152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1122  tetratricopeptide region  60.07 
 
 		 283 aa  341  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124887  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  60.31 
 
 		 281 aa  325  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  23.11 
 
 		 637 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  27.86 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  19.59 
 
 		 1154 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2854  hypothetical protein  35.14 
 
 		 585 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 503 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 3301 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 3172 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>