14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3302 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3302  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 456 aa  906    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  46.56 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0405  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.98 
 
 		 477 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.878783 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  27.59 
 
 		 661 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  25.86 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  25.69 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  25.94 
 
 		 619 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33726  Glucoamylase GLU1 precursor (Glucan 1,4-alpha-glucosidase) (1,4-alpha-D-glucan glucohydrolase)  22.73 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5985  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.17 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02630  glucan 1,4-alpha-glucosidase, putative  22.29 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.78 
 
 		 604 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  26.23 
 
 		 650 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  27.59 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  22.9 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>