50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1754 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  38.31 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  31.53 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  37.21 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  32.99 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  31.82 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  34.18 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  31.25 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  31.41 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  26.94 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  27.48 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  28.77 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  26.98 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  31.28 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  31.74 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  28.92 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  25.59 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  27.35 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  28.96 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  32.23 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  26.48 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  23.94 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  27.62 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  24.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  30.71 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  23.27 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.65 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  28.1 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  30.68 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  27.5 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  23.87 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  31.62 
 
 		 433 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  29.53 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  29.53 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.17 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  28.67 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  24.38 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  25.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  25.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  25.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  24.65 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  25.33 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  21.76 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.41 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  24.89 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.88 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  23.12 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>