23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1629 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1207    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1131 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  30.1 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  31.48 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  31.53 
 
 		 847 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  29.73 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  30.32 
 
 		 863 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  29.36 
 
 		 860 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1076 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  24.47 
 
 		 857 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  27.85 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  25.46 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  26.45 
 
 		 888 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  30.17 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1093 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  26.11 
 
 		 702 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  30.51 
 
 		 688 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  24.49 
 
 		 882 aa  52  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  25 
 
 		 712 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  22.7 
 
 		 851 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1307 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1057 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  22.38 
 
 		 673 aa  43.9  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>