18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1480 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  758    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  31.17 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  23.32 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  25.53 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  31.3 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  29.63 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  26.43 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  22.89 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  26.17 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  31.8 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  29.73 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  29.78 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  24.49 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  22.77 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  27.31 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  25.97 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0310  hypothetical protein  33.81 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>