34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4922 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.538934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  46.95 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  42.94 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  43.4 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  43.24 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  43.24 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  41.77 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  41.77 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  40.48 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  41.77 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  40.52 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  33.59 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  33.59 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  35.61 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  35.61 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  30.91 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  33.08 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  33.08 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  33.08 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  31.48 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  31.48 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  31.48 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  33.08 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  32.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  32.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>