43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1996 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  86.92 
 
 		 130 aa  206  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  79.69 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  67.57 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  59.68 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  62.5 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  52.68 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  64.89 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  65.59 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  65.59 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  65.59 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  63.83 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  57.14 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  61.86 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  54.55 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  54.55 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  56.76 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  55.14 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  57.66 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  56.67 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  50.43 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  56.82 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  56.82 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  56.82 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  56.82 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  56.82 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  52.48 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  58 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  44.74 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  55.68 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  51.38 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  48.65 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  56.88 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  41.82 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  47.62 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  52.59 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  47.41 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  34.4 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  50 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  42.62 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>