16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5406 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  91.3 
 
 		 69 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  45.59 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0005  hypothetical protein  51.06 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.711557  normal  0.0680728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0005  hypothetical protein  47.17 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.221956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  39.68 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  47.73 
 
 		 143 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  43.94 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  45 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>