26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4250 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  75.3 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  48.41 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  50.97 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  47.77 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  48.37 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  46.54 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  50.36 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  48.92 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  49.28 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  49.28 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  49.28 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  48.55 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  29.86 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  35.34 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  33.86 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  29.6 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  31.09 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  23.84 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  26.47 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  29.36 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  21.94 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  22.58 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.48 
 
 		 466 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 374 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>