24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1288 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  89.32 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  71.88 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  47.06 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  39.39 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  39.39 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  39.39 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  37.88 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4831  hypothetical protein  42.03 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2456  hypothetical protein  34.41 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000164028  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  32.76 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2284  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16021  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>