43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5051 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  262  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  58.39 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  58.87 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  45.71 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  45.07 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  63.31 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  61.82 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  61.82 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  48.57 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  61.82 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  56.3 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  86.21 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  47.83 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  82.76 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  32.39 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  74.19 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  78.57 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  75 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  68.42 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  33.96 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  81.48 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  55.81 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  33.96 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  76 
 
 		 210 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  27.97 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  73.08 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  54.84 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  65.38 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  58.06 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  47.37 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  35.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  35.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  64.29 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  69.23 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  65.38 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  65.38 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  59.26 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  61.54 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  32.24 
 
 		 157 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0100  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>