26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2138 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  93.21 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  92.59 
 
 		 162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  85.8 
 
 		 162 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  63.92 
 
 		 163 aa  227  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  66.46 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  60.78 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  43.15 
 
 		 302 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  43.84 
 
 		 301 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  45.77 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  43.15 
 
 		 302 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  43.84 
 
 		 301 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  45.52 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  43.31 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  32.89 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  30.07 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  29.25 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  25.55 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  25.55 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  24.82 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  26.81 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  27.81 
 
 		 272 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  29.89 
 
 		 175 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  24.82 
 
 		 337 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>