15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3697 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  347  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  92.53 
 
 		 174 aa  327  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  28.95 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3759  hypothetical protein  27.72 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.72 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2852  hypothetical protein  23 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.69 
 
 		 512 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  31.08 
 
 		 161 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  29.11 
 
 		 190 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  35.9 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  35.9 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.58 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  38 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>