16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2922 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  85.08 
 
 		 249 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1011  hypothetical protein  51.23 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.823882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3331  hypothetical protein  52.87 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  36.5 
 
 		 1141 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.78 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  37.4 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1696  FHA domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2321  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.380377 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 569 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  37.63 
 
 		 1017 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 888 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  37.23 
 
 		 841 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  42.37 
 
 		 567 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>