12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1475 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  748    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0094  hypothetical protein  41.99 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  33.82 
 
 		 427 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1585  hypothetical protein  31.14 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  30.4 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  27.44 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  26.43 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  32.85 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  29.55 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3427  hypothetical protein  27.74 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26090  hypothetical protein  29.09 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>