More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1164 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  95.05 
 
 
226 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  73.64 
 
 
222 aa  350  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4935  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  58.96 
 
 
218 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000314171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  52.83 
 
 
217 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  51.4 
 
 
214 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  48.58 
 
 
213 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  50.94 
 
 
215 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  50.47 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  49.53 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  48.11 
 
 
213 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  228  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  48.15 
 
 
217 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  48.83 
 
 
215 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  50.49 
 
 
216 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  48.15 
 
 
217 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  224  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  48.6 
 
 
217 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  49.77 
 
 
214 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  48.61 
 
 
217 aa  221  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  49.06 
 
 
216 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  46.76 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.76 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  48.18 
 
 
423 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  47.64 
 
 
215 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  48.37 
 
 
215 aa  218  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.83 
 
 
217 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.89 
 
 
216 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.23 
 
 
216 aa  214  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.23 
 
 
216 aa  214  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  52.79 
 
 
213 aa  214  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_437  adenylate kinase  49.53 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000304823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0495  adenylate kinase  49.06 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125231  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  47.44 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  47.64 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  46.98 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0472  adenylate kinase  49.53 
 
 
216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00114674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  47.22 
 
 
217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  46.01 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  211  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  48.11 
 
 
214 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.58 
 
 
214 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.4 
 
 
215 aa  209  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  45.75 
 
 
214 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  43.72 
 
 
218 aa  207  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  51.47 
 
 
224 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  47.64 
 
 
208 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  43.93 
 
 
214 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  45.37 
 
 
217 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  45.37 
 
 
217 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  46.15 
 
 
225 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.82 
 
 
224 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  44.39 
 
 
215 aa  205  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  46.73 
 
 
219 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  204  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  47.89 
 
 
209 aa  203  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  46.05 
 
 
217 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.69 
 
 
211 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  47.06 
 
 
208 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  45.07 
 
 
208 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  44.44 
 
 
217 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.77 
 
 
227 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  47.25 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  48.37 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.75 
 
 
211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  46.38 
 
 
229 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  43.66 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  44.6 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  48.15 
 
 
216 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  43.46 
 
 
218 aa  194  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0736  adenylate kinase  44.39 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  43.13 
 
 
220 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  43.13 
 
 
220 aa  194  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  43.52 
 
 
218 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  44.34 
 
 
214 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  44.44 
 
 
229 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  44.44 
 
 
217 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.81 
 
 
217 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  44.39 
 
 
219 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  44.39 
 
 
228 aa  191  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  45 
 
 
216 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  51.08 
 
 
221 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  42.86 
 
 
218 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.86 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  45.67 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  42.33 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  45.24 
 
 
229 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3974  adenylate kinase  45.07 
 
 
210 aa  188  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>