34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5763 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  341  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  46.34 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.538934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  46.34 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  45.93 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  47.8 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  46.56 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  45.91 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  45.91 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  45.91 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  46.21 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  44.97 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  44.97 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  43.62 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  38.64 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  38.64 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  38.64 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  37.12 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  34.85 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  35.61 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  34.09 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>