28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4767 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  100 
 
 		 42 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  58.54 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  58.54 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  69.7 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  58.54 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  69.7 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  62.16 
 
 		 44 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  78.57 
 
 		 46 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  60.61 
 
 		 44 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  60.61 
 
 		 44 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  60.61 
 
 		 44 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  60.61 
 
 		 44 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  60.61 
 
 		 44 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  57.58 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  66.67 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  58.97 
 
 		 44 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  47.22 
 
 		 45 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  43.9 
 
 		 43 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1205  entericidin-related protein  68 
 
 		 44 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  55.17 
 
 		 44 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0196  bacteriolytic lipoprotein entericidin B.-related protein  68 
 
 		 44 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1513  entericidin EcnAB  60.71 
 
 		 45 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.839943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1603  bacteriolytic lipoprotein entericidin B  68 
 
 		 44 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1685  entericidin EcnAB  68 
 
 		 44 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  53.12 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  46.34 
 
 		 47 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2474  entericidin EcnAB  60.71 
 
 		 44 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.376001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>