More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3710 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.04 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  69.23 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  50 
 
 		 105 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  73.21 
 
 		 100 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.78 
 
 		 64 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.78 
 
 		 61 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  71.43 
 
 		 60 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  70.37 
 
 		 461 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  69.09 
 
 		 91 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.75 
 
 		 70 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.75 
 
 		 70 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.75 
 
 		 70 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.75 
 
 		 70 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.93 
 
 		 64 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  70.91 
 
 		 67 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.64 
 
 		 63 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  69.64 
 
 		 63 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.64 
 
 		 60 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  69.09 
 
 		 56 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  70.91 
 
 		 67 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.64 
 
 		 60 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  70.91 
 
 		 67 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  70.91 
 
 		 67 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  70.91 
 
 		 60 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  70.91 
 
 		 60 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.06 
 
 		 70 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.91 
 
 		 60 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.27 
 
 		 56 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  67.27 
 
 		 56 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.91 
 
 		 58 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 		 56 aa  90.9  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 		 56 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.45 
 
 		 56 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  74.07 
 
 		 54 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  64.81 
 
 		 477 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  63.64 
 
 		 60 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 		 60 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 		 60 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 		 56 aa  88.6  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.07 
 
 		 59 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  64.29 
 
 		 58 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  64.29 
 
 		 58 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 		 56 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 		 57 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 55 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  66.67 
 
 		 54 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 		 54 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 55 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 		 56 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.31 
 
 		 55 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 55 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 55 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 55 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  52.46 
 
 		 70 aa  84.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  64.15 
 
 		 55 aa  84.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.96 
 
 		 55 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  64.81 
 
 		 55 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  64.81 
 
 		 55 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.38 
 
 		 56 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 		 63 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.34 
 
 		 62 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 		 56 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 54 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.11 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  57.89 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.45 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.93 
 
 		 57 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.96 
 
 		 55 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 		 55 aa  80.9  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.56 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3579  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68 
 
 		 50 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0406077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  64.15 
 
 		 56 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2902  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68 
 
 		 50 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.26 
 
 		 55 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  60.38 
 
 		 57 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  61.11 
 
 		 55 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  60.38 
 
 		 57 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  61.11 
 
 		 55 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 		 54 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.96 
 
 		 54 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 		 55 aa  78.6  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.96 
 
 		 54 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2099  hypothetical protein  64.52 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  59.26 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.36 
 
 		 57 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2004  hypothetical protein  64.52 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  58.49 
 
 		 58 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>