23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3660 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3660  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5415  putative lipoprotein  49.32 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2327  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4364  signal peptide protein  38.46 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4254  putative signal peptide protein  38.46 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.319211 
 
 
-
 
NC_003296  RS02588  signal peptide protein  41.86 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2792  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1409  hypothetical protein  36.71 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2536  hypothetical protein  35.85 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1659  hypothetical protein  42.55 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69389  normal  0.537335 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1772  hypothetical protein  35.85 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0123  hypothetical protein  35.85 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000625285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1774  hypothetical protein  35.85 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0042105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1795  hypothetical protein  35.85 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000175143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1042  hypothetical protein  35.85 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4667  hypothetical protein  30.21 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613007  decreased coverage  0.000608941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1949  hypothetical protein  35.85 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000272538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4451  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1503  hypothetical protein  35.59 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1527  hypothetical protein  35.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.149151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1047  hypothetical protein  35.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1726  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000356622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>