11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2526 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2526  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00348782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.64 
 
 		 1007 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50571  predicted protein  30.62 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3033  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 		 895 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214137  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5567  hypothetical protein  30.6 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5554  hypothetical protein  28.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  28.46 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4033  hypothetical protein  28.85 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273753  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 170 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0879  2'-5' RNA ligase  21.18 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.447955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>