80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0999 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0999  Indigoidine synthase A family protein  100 
 
 
293 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.35939  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0138  Indigoidine synthase A family protein  47.67 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0900  indigoidine synthase A family protein  44.09 
 
 
306 aa  258  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2165  Indigoidine synthase A family protein  50.37 
 
 
301 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0259  indigoidine synthase A family protein  47.12 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1914  Indigoidine synthase A family protein  45.16 
 
 
305 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1446  indigoidine synthase A family protein  49.3 
 
 
304 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2724  indigoidine synthase A family protein  48.39 
 
 
304 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02094  hypothetical protein  47.14 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.681042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2302  indigoidine synthase A like protein  47.14 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1483  indigoidine synthase A family protein  47.14 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  hitchhiker  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02053  hypothetical protein  47.14 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.6313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2462  indigoidine synthase A like protein  47.14 
 
 
312 aa  242  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.346353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2312  indigoidine synthase A like protein  47.14 
 
 
312 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  decreased coverage  0.000230697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1352  indigoidine synthase A family protein  45.88 
 
 
304 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.866108  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0800  indigoidine synthase A like protein  46.79 
 
 
312 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.606366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1493  Indigoidine synthase A family protein  46.79 
 
 
312 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3301  indigoidine synthase A like protein  46.43 
 
 
312 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.025754  normal  0.0279599 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0554  Indigoidine synthase A family protein  43.57 
 
 
304 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0662  Indigoidine synthase A family protein  43.21 
 
 
308 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2950  indigoidine synthase A family protein  46.24 
 
 
304 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0302  hypothetical protein  43.88 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0295  hypothetical protein  43.88 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.481774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0773  Indigoidine synthase A family protein  49.82 
 
 
305 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.815514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2858  IndA involved in pigment biosynthesis  48.94 
 
 
303 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1435  indigoidine synthase A family protein  48.94 
 
 
303 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3009  indigoidine synthase A family protein  50.19 
 
 
303 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6602  indigoidine synthase A family protein  47.65 
 
 
328 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5964  Indigoidine synthase A family protein  49.1 
 
 
300 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1892  hypothetical protein  44.24 
 
 
308 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5516  indigoidine synthase A like protein  47.99 
 
 
350 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1663  indigoidine synthase A family protein  51.85 
 
 
308 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.719701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1903  hypothetical protein  44.24 
 
 
308 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1508  indigoidine synthase A family protein  48.75 
 
 
303 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0105749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1813  indigoidine synthase A family protein  48.9 
 
 
304 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114344  decreased coverage  0.0086217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0357  indigoidine synthase A like protein  47.78 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115548  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2308  indigoidine synthase A like protein  47 
 
 
302 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0080  indigoidine synthase A like protein  47.41 
 
 
319 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1187  indigoidine synthase A family protein  40.7 
 
 
296 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2110  indigoidine synthase A-like protein  45.2 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.170827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4621  indigoidine synthase A family protein  47.16 
 
 
307 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00515504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2171  Indigoidine synthase A family protein  46.98 
 
 
308 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0461941  normal  0.0538541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3582  indigoidine synthase A family protein  51.46 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2391  Indigoidine synthase A family protein  52.29 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000115513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2560  hypothetical protein  46.76 
 
 
307 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.80027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1065  Indigoidine synthase A family protein  48.76 
 
 
294 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891899  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1339  indigoidine synthase A like protein  45.39 
 
 
302 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6279  Indigoidine synthase A family protein  47.45 
 
 
317 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2613  Indigoidine synthase A family protein  48.94 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0176684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1960  Indigoidine synthase A family protein  45.74 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1375  indigoidine synthase A family protein  48.77 
 
 
311 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1524  indigoidine synthase A family protein  46.1 
 
 
309 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0175731  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1265  indigoidine synthase A like protein  47.04 
 
 
304 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1045  Indigoidine synthase A family protein  50.37 
 
 
337 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1754  Indigoidine synthase A family protein  46.26 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6401  hypothetical protein  45.88 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1239  indigoidine synthase A family protein  41.28 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0227  indigoidine synthase A family protein  45.42 
 
 
306 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3777  Indigoidine synthase A family protein  47.43 
 
 
306 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102036  normal  0.785872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0071  Indigoidine synthase A family protein  40.65 
 
 
316 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9211  predicted protein  40.74 
 
 
310 aa  192  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9308  predicted protein  40.74 
 
 
310 aa  192  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00121842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2147  Indigoidine synthase A family protein  47.6 
 
 
301 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175649  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3557  Indigoidine synthase A family protein  47.65 
 
 
316 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0490  indigoidine synthase A like protein  49.05 
 
 
302 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1699  indigoidine synthase A family protein  40.62 
 
 
308 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2212  indigoidine synthase A family protein  48.39 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  hitchhiker  0.00929009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24430  uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis  47.18 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1436  indigoidine synthase A family protein  47.06 
 
 
307 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415286  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1471  indigoidine synthase A family protein  47.43 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38766  predicted protein  36.43 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0468003 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26294  predicted protein  43.16 
 
 
333 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.108227  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  42.7 
 
 
759 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1601  indigoidine synthase A like protein  49.82 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1499  Indigoidine synthase A family protein  45.42 
 
 
302 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1329  indigoidine synthase A family protein  37.94 
 
 
284 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000426313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1357  indigoidine synthase A family protein  38.25 
 
 
285 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143413  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07471  IdgA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05800)  37.63 
 
 
735 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2350  Indigoidine synthase A family protein  49.82 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.889274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2262  Indigoidine synthase A family protein  49.64 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>