80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2724 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2724  indigoidine synthase A family protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1352  indigoidine synthase A family protein  87.5 
 
 		 304 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.866108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1446  indigoidine synthase A family protein  87.5 
 
 		 304 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2950  indigoidine synthase A family protein  87.17 
 
 		 304 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1914  Indigoidine synthase A family protein  69.93 
 
 		 305 aa  447  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0138  Indigoidine synthase A family protein  66.67 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02094  hypothetical protein  65.78 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.681042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2302  indigoidine synthase A like protein  65.78 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1483  indigoidine synthase A family protein  65.78 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  hitchhiker  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3301  indigoidine synthase A like protein  66.45 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.025754  normal  0.0279599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02053  hypothetical protein  65.78 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.6313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1493  Indigoidine synthase A family protein  66.11 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2462  indigoidine synthase A like protein  65.78 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.346353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2312  indigoidine synthase A like protein  65.78 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  decreased coverage  0.000230697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0800  indigoidine synthase A like protein  65.45 
 
 		 312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.606366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0554  Indigoidine synthase A family protein  63.79 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0662  Indigoidine synthase A family protein  62.71 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0259  indigoidine synthase A family protein  60.4 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0900  indigoidine synthase A family protein  59.87 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2165  Indigoidine synthase A family protein  62.72 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0302  hypothetical protein  58.75 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0295  hypothetical protein  58.75 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.481774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0080  indigoidine synthase A like protein  60.07 
 
 		 319 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6602  indigoidine synthase A family protein  58.5 
 
 		 328 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0357  indigoidine synthase A like protein  60.42 
 
 		 313 aa  339  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5516  indigoidine synthase A like protein  60.81 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4621  indigoidine synthase A family protein  58.39 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00515504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6279  Indigoidine synthase A family protein  59.79 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2110  indigoidine synthase A-like protein  55.52 
 
 		 305 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.170827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1892  hypothetical protein  52.3 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1903  hypothetical protein  52.3 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1508  indigoidine synthase A family protein  55.1 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0105749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1663  indigoidine synthase A family protein  58.08 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.719701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0071  Indigoidine synthase A family protein  48.33 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2308  indigoidine synthase A like protein  53.74 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1339  indigoidine synthase A like protein  55.1 
 
 		 302 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1813  indigoidine synthase A family protein  53.33 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114344  decreased coverage  0.0086217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3009  indigoidine synthase A family protein  55.83 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2858  IndA involved in pigment biosynthesis  52.84 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1435  indigoidine synthase A family protein  52.84 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1960  Indigoidine synthase A family protein  54.48 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2171  Indigoidine synthase A family protein  54.48 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0461941  normal  0.0538541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3582  indigoidine synthase A family protein  52.94 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1375  indigoidine synthase A family protein  53.22 
 
 		 311 aa  291  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1524  indigoidine synthase A family protein  53.56 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0175731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2560  hypothetical protein  53.45 
 
 		 307 aa  288  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.80027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1045  Indigoidine synthase A family protein  56.01 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1187  indigoidine synthase A family protein  48.97 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5964  Indigoidine synthase A family protein  49.16 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1265  indigoidine synthase A like protein  53.45 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38766  predicted protein  50 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0468003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1699  indigoidine synthase A family protein  47.49 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1436  indigoidine synthase A family protein  53.22 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415286  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1754  Indigoidine synthase A family protein  49.16 
 
 		 313 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0227  indigoidine synthase A family protein  47.9 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1499  Indigoidine synthase A family protein  52.31 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26294  predicted protein  50.84 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.108227  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2613  Indigoidine synthase A family protein  50 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0176684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3777  Indigoidine synthase A family protein  49.83 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102036  normal  0.785872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6401  hypothetical protein  47.8 
 
 		 312 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2391  Indigoidine synthase A family protein  50 
 
 		 315 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000115513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1471  indigoidine synthase A family protein  53.26 
 
 		 324 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24430  uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis  48.68 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0999  Indigoidine synthase A family protein  48.39 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.35939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1239  indigoidine synthase A family protein  44 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0490  indigoidine synthase A like protein  49.1 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1065  Indigoidine synthase A family protein  46.15 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2147  Indigoidine synthase A family protein  47.24 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3557  Indigoidine synthase A family protein  49.14 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9308  predicted protein  44.52 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00121842  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9211  predicted protein  44.52 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  46.13 
 
 		 759 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0773  Indigoidine synthase A family protein  43.14 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.815514 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07471  IdgA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05800)  43.66 
 
 		 735 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2212  indigoidine synthase A family protein  43.49 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  hitchhiker  0.00929009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1329  indigoidine synthase A family protein  38.23 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000426313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1357  indigoidine synthase A family protein  36.18 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1601  indigoidine synthase A like protein  42.12 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2350  Indigoidine synthase A family protein  42.66 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.889274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2262  Indigoidine synthase A family protein  43.06 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>