80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2560 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.80027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1960  Indigoidine synthase A family protein  82.68 
 
 		 308 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2171  Indigoidine synthase A family protein  82.35 
 
 		 308 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0461941  normal  0.0538541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1524  indigoidine synthase A family protein  77.78 
 
 		 309 aa  447  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0175731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1339  indigoidine synthase A like protein  63.18 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2110  indigoidine synthase A-like protein  64.66 
 
 		 305 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.170827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1508  indigoidine synthase A family protein  61.28 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0105749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2858  IndA involved in pigment biosynthesis  60.61 
 
 		 303 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2308  indigoidine synthase A like protein  59.06 
 
 		 302 aa  344  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1435  indigoidine synthase A family protein  60.27 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831364 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0295  hypothetical protein  56.76 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.481774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0302  hypothetical protein  56.76 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1813  indigoidine synthase A family protein  60.98 
 
 		 304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114344  decreased coverage  0.0086217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1663  indigoidine synthase A family protein  62.77 
 
 		 308 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.719701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1265  indigoidine synthase A like protein  67.38 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2165  Indigoidine synthase A family protein  58.66 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0259  indigoidine synthase A family protein  54.27 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1446  indigoidine synthase A family protein  55.86 
 
 		 304 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0900  indigoidine synthase A family protein  54 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0080  indigoidine synthase A like protein  58.42 
 
 		 319 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1045  Indigoidine synthase A family protein  62.19 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2950  indigoidine synthase A family protein  54.83 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1892  hypothetical protein  51.88 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0554  Indigoidine synthase A family protein  55.32 
 
 		 304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1903  hypothetical protein  51.88 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0138  Indigoidine synthase A family protein  52.38 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2724  indigoidine synthase A family protein  53.45 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000826173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5516  indigoidine synthase A like protein  57.78 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0357  indigoidine synthase A like protein  58.21 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1352  indigoidine synthase A family protein  53.1 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.866108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6602  indigoidine synthase A family protein  53.61 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4621  indigoidine synthase A family protein  57.24 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00515504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1914  Indigoidine synthase A family protein  51.02 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0662  Indigoidine synthase A family protein  50 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02053  hypothetical protein  52.33 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.6313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2302  indigoidine synthase A like protein  52.33 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1483  indigoidine synthase A family protein  52.33 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  hitchhiker  0.0000193345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02094  hypothetical protein  52.33 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.681042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3009  indigoidine synthase A family protein  53.9 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2462  indigoidine synthase A like protein  52.33 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.346353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2312  indigoidine synthase A like protein  52.33 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  decreased coverage  0.000230697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3301  indigoidine synthase A like protein  52 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.025754  normal  0.0279599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6279  Indigoidine synthase A family protein  57.56 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0800  indigoidine synthase A like protein  52 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.606366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1493  Indigoidine synthase A family protein  52 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6401  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1375  indigoidine synthase A family protein  50.67 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2613  Indigoidine synthase A family protein  53.9 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0176684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3582  indigoidine synthase A family protein  51.53 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5964  Indigoidine synthase A family protein  50.68 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1699  indigoidine synthase A family protein  45.12 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0071  Indigoidine synthase A family protein  44.37 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9308  predicted protein  49.18 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00121842  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  51.92 
 
 		 759 aa  253  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9211  predicted protein  49.18 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2391  Indigoidine synthase A family protein  49.45 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000115513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1187  indigoidine synthase A family protein  42.23 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26294  predicted protein  47.6 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.108227  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2147  Indigoidine synthase A family protein  49.65 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1754  Indigoidine synthase A family protein  47.46 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38766  predicted protein  45.57 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0468003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3777  Indigoidine synthase A family protein  46.69 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102036  normal  0.785872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0773  Indigoidine synthase A family protein  45.89 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.815514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0227  indigoidine synthase A family protein  45.7 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1499  Indigoidine synthase A family protein  48.4 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07471  IdgA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05800)  46.45 
 
 		 735 aa  228  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24430  uncharacterized enzyme involved in pigment biosynthesis  44.95 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0999  Indigoidine synthase A family protein  46.76 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.35939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3557  Indigoidine synthase A family protein  47.42 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1436  indigoidine synthase A family protein  48.78 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415286  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1239  indigoidine synthase A family protein  43.32 
 
 		 272 aa  225  9e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1065  Indigoidine synthase A family protein  43.99 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1471  indigoidine synthase A family protein  48.08 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0490  indigoidine synthase A like protein  46.29 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2212  indigoidine synthase A family protein  42.76 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  hitchhiker  0.00929009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1329  indigoidine synthase A family protein  35.56 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000426313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1357  indigoidine synthase A family protein  35.92 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2350  Indigoidine synthase A family protein  47.16 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.889274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1601  indigoidine synthase A like protein  46.42 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2262  Indigoidine synthase A family protein  47.28 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>