15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4748 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  93.28 
 
 		 506 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1052    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  45.9 
 
 		 536 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  42.8 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  44.04 
 
 		 569 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  40.64 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0403  hypothetical protein  47.01 
 
 		 222 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  28.18 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  25.49 
 
 		 570 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  24.45 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  24.33 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  34.65 
 
 		 622 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0974  hypothetical protein  33.61 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.518342  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1839  signal peptide and transmembrane prediction  30.65 
 
 		 648 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  23.05 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>