32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3522 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  100 
 
 		 125 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  84.8 
 
 		 125 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  35.54 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.78 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  32.17 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  27.19 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  28.81 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.06 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  31.48 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  32.41 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  43.66 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.93 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  28.18 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  23.08 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  41.57 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  25.66 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  31.4 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  31.4 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  31.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  26.51 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  31.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  31.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  31.4 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  31.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  31.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.27 
 
 		 139 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  34.15 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.15 
 
 		 137 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.27 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>