22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0562 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0562  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0518  putative glycosyltransferase protein  89.53 
 
 
172 aa  317  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  0.387851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0939  hypothetical protein  65.12 
 
 
173 aa  228  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0453  hypothetical protein  55.81 
 
 
182 aa  204  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297407  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_004310  BR0388  hypothetical protein  34.76 
 
 
168 aa  101  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0400  hypothetical protein  34.76 
 
 
168 aa  101  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0509  hypothetical protein  31.71 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4363  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273335  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  35 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1205  hypothetical protein  32.23 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  34 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2337  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2163  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0441  hypothetical protein  29.49 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1769  hypothetical protein  32.82 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2105  hypothetical protein  32.82 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.754468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1742  hypothetical protein  32.73 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112466  normal  0.298873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  29.7 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
640 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>