22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0344 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
316 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  94.94 
 
 
316 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0726  flagellar motor switch protein  57.05 
 
 
319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0249  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.68 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0668942  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  28.63 
 
 
303 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0304  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.54 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  28.2 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.2 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  23.17 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  23.98 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  22.81 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  26.16 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  22.12 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  21.11 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  30.23 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  27.85 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  23.02 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.19 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  26.51 
 
 
400 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>