17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6182 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  53.2 
 
 
327 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  51.16 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  52.33 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  51.84 
 
 
319 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  50.33 
 
 
322 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  50.17 
 
 
402 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  49.5 
 
 
311 aa  271  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  50 
 
 
343 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  48.68 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  49.33 
 
 
308 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  42.53 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.21 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  28.85 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  24.35 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  33.8 
 
 
517 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  22.95 
 
 
918 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>