32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6026 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 270 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  89.26 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  66.67 
 
 		 271 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  54.1 
 
 		 276 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  52.99 
 
 		 274 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  52.99 
 
 		 274 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  53.73 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  55.06 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  53.23 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  51.53 
 
 		 276 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  52.61 
 
 		 274 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  52.45 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  53.9 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.96 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  53.58 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  53.03 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  47.35 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  48.48 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.25 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  36.02 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  25.82 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0115  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99603  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  28.21 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  29.14 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.64 
 
 		 633 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2346  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  27.27 
 
 		 635 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.9 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2130  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.14 
 
 		 635 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402618  normal  0.678263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38100  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.11 
 
 		 632 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.749235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  27.27 
 
 		 634 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  27.61 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>