38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4405 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 		 265 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.39 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.85 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.66 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.09 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.36 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.7 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.6 
 
 		 284 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.54 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.66 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.72 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  39.46 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.25 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.11 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.82 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.96 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.03 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  25.96 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  25.96 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  25.96 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.94 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  24.81 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46734  predicted protein  30.39 
 
 		 438 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  29.87 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.5 
 
 		 443 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.99 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.8 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0694  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.37 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.38 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.47 
 
 		 407 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.8 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.8 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  41.1 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0777  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.25 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.19 
 
 		 458 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.91 
 
 		 219 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>