40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2954 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  65.08 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  64.29 
 
 		 128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  70.8 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  63.72 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  62.5 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  66.37 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  59.84 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  35.66 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  31.47 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  33.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  33.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  33.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  30.77 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  33.08 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  30 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  31.39 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  32.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  32.23 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  28.36 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  40.24 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  29.06 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  29.82 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  26.77 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  29.46 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  32.17 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  33.73 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>