14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1447 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1447  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  215  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.83167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1011  hypothetical protein  41.58 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.65 
 
 		 522 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1833  hypothetical protein  36.19 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730999  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.16 
 
 		 576 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  52.78 
 
 		 986 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  40.82 
 
 		 1448 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1448 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1580 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1077 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  35.94 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  39.53 
 
 		 408 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a032  putative DNA primase TraC  34.78 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00688242  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  28 
 
 		 430 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>