12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3427 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  870    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  41.47 
 
 		 776 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  40.15 
 
 		 776 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  33.49 
 
 		 751 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  29.19 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  29.19 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  34.02 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 765 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 766 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  24.36 
 
 		 746 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  30.25 
 
 		 910 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.23 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>