13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3397 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3397  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1100    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3542  hypothetical protein  62.48 
 
 		 615 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  27.2 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  26.06 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  26.61 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  26.63 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  29.14 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  27.86 
 
 		 413 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  29.14 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  28.48 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  27.12 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  24.81 
 
 		 407 aa  100  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  26.74 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>